Ob die Übersehene Stendelwurz eine „gute“ (anerkannte) Art ist, ist letztlich Ansichtssache. Von manchen Autoren wird sie als solche eingestuft, andere sehen sie als Unterart der Schmallippigen Stendelwurz – für beide Auffassungen gibt es Argumente. Genetisch sind die beiden Sippen kaum zu trennen. Die Sippe wurde erst 1986 beschrieben; der Locus classicus befindet sich auf der Meininger Muschelkalkplatte bei Herpf.

Die Blätter der Übersehenen Stendelwurz sind dunkler und nicht so steif, sie blüht etwa eine Woche eher. Der Durchgang zwischen Vorder- und Hinterlippe (Epi- und Hypochil) ist bei Epipactis leptochila breiter (u- oder v-förmig), bei E. neglecta sehr schmal („schlüssellochförmig“), teils berühren sich deren Ränder. Die Spitze der Lippe (bzw. des Epichils) ist nach unten gebogen. Anzumerken ist jedoch, dass diese Sippe als sehr variabel bezeichnet wird.

Die Sippe kommt in Europa von Südengland bis Süditalien und Griechenland vor, besiedelt aber wohl kein zusammenhängendes Areal. In Deutschland ist sie bisher nur in einem kleinen Gebiet von Nordbayern über Südthüringen nach Osthessen und an wenigen Stellen Südniedersachsens beobachtet worden.

In Thüringen ist sie im Zechsteingürtel der Mittelgebirgsränder sowie den Muschelkalk-Hügelländern West- und Südthüringens relativ häufig nachgewiesen worden. Aus dem (kontinentaler geprägten) Muschelkalkgebiet zwischen Rudolstadt und Jena gibt es nur sehr wenige Meldungen. Möglicherweise hängt dies jedoch auch damit zusammen, dass die Sippe von vielen Geländebotanikern nicht erkannt wurde. Die Lebensräume der Übersehenen Stendelwurz in Thüringen sind Laub(misch)wälder mit deutlich subozeanisch getöntem Klima, wo diese Sippe gern in feuchten nach Nordwest exponierten Unterhanglagen siedelt.

Auch sie ist durch die Intensivierung der Forstwirtschaft (Einsatz schwerer Technik), vor allem durch die Fällung alter Buchen, gefährdet. In Thüringen ist sie (als Unterart der Schmallippigen Stendelwurz) in der „Vorwarnliste“ zur Roten Liste enthalten.